中共十七大报告提出医改方向要实现四个分开，即“政事分开、管办分开、医药分开、营利性和非营利性分开”。其中医药分开被看作切断以药养医的重要切入点。如今，一些城市尝试在医疗机构内部将行医和卖药分开。北京启动医药分开试点，上海、深圳等地也将试行。

　　中投顾问医药行业研究员郭凡礼指出，虽然目前北京等城市提出医药分开，却不能完全杜绝医生、医院与药品利益挂钩问题。从体制的角度来看，这是由医院体制改革和医疗卫生体制改革没有共同推进所导致的。从利益链的角度来考虑，单单是药房与医院分离，触动不了医生与药商之间的利益，隐形收入仍存在。

　　郭凡礼指出，但要从源头杜绝医生与药品利益，仍需推动公立医院与民营医院体制走向市场化、商业化。而在此过程中，有效杜绝医生收取过高的费用可以从三个渠道加强。首先加强医药专业人才素质培养。其次建立廉洁、高效的责任班子，第三定期或不定期查处公立及民营医药灰色收入，并处于罚款、没收、通报批评等处罚。

　　目前政府对医院投入有限，让医院彻底放弃药品利益并不是没有可能，这主要取决于三因素：首先是民营资本、外国资本、VC、PE参与医疗改革参与程度与构成比例。其次要看公立医院与民营医院体制改革转向，是朝着非营利性还是盈利性方向发展。第三要看医药分离政策实施情况及监管措施落实程度。在政策作用及民营资本等引入过程中，相关的政策补贴及医务人员工作绩效能否有效衔接，这也体现了医院改革进程能否得到根本性的改变。

　　郭凡礼表示，商务部愿意介入医改，目的为将目前边缘化的药房纳入体系，但这又存在另一个问题，那就是卫生部与商务部的利益之争。从卫生部的角度来看，对医院及药品进行监管之间存在利益链条，其中涉及医生额外收入、药品加成等费用。如果一旦将这一块交由商务部管，这会导致其与卫生部职能、利益等产生冲突。

　　郭凡礼同时表示，目前推进医药分开的难点在于五方面：首先是如何有效平衡医院、药商、医生这三者的利益。其次如何取得地方政府的信任并支持医药分离政策。第三如何有效提高医务人员素质，提升服务水平并加强工作绩效。第四如何提高药品质量、健全监督体制以及提高药事服务能力。第五如何引入资金参与医药分业政策改革。